El órgano ejecutivo de la OCDE es el Consejo, el cual está integrado por los Embajadores de los 38 países miembros. Aquí se toman las decisiones que tienen implicancias para la Organización. El consejo cuenta con subcomités como el Comité Ejecutivo (EXCO), el Comité de Presupuesto y el Comité de Relaciones Exteriores (ERC por sus siglas en inglés), los cuales lo apoyan en el cumplimiento de sus funciones.

Luego, existen 12 directorados o departamentos temáticos. En cada uno de ellos se discuten los temas que corresponden a su área temática. Adicionalmente, la OCDE cuenta con 4 entidades especiales, que son: el Foro Internacional de Transportes (ITF), el Centro de Desarrollo (DEV), la Agencia Internacional de Energía (IEA), y la Agencia de Energía Nuclear.

Dentro de los directorados existen más de 300 comités, grupos de trabajos y grupos de expertos sustantivos. Los Comités corresponden a la instancia técnica más importante de cada área, en ellos participan los representantes de cada país según el tema específico que trate el comité. En los comités se proponen soluciones, se analizan datos y se evalúan los progresos de cada país en las respectivas materias.

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